Tabla de contenido
¿Qué EMBL?
El EMBL es una de las instituciones de investigación líderes en el mundo y el laboratorio insignia de Europa para las ciencias de la vida.
¿Qué son las bases de datos Bioinformaticas?
Una base de datos biológica es una colección de información sobre ciencias de la vida, recogida de experimentos científicos, literatura publicada, tecnología de experimentación de alto rendimiento, y análisis computacional.
¿Qué es y para qué sirve la base de datos del GenBank?
GenBank es una base de datos exhaustiva, una colección anotada de las secuencias de nucleótidos disponibles al público de decenas de miles de organismos.
¿Qué es la base de datos Refseq?
Refseq (Reference Sequence) es otra base de datos de nucleótidos mantenida por el NCBI. Es una colección de secuencias de ADN, ARN y proteínas mantenida y revisada. Sólo tiene una secuencia por gen y organismo. Tiene entradas independientes para el ADN genómico, el transcrito y las proteínas.
¿Qué es la base de datos UniProt?
UniProt (de universal protein) es un repositorio central de datos gratuito sobre proteínas. Esto lo ha convertido en el recurso líder a nivel mundial en cuanto al almacenamiento de información sobre proteínas.
¿Qué son bases secundarias?
Las bases de datos secundarias contienen información derivada de bases de datos primarias. Las bases de datos secundarias almacenan información, como secuencias conservadas, residuos de sitios activos y secuencias de firmas. Los datos del banco de datos de proteínas se almacenan en bases de datos secundarias.
¿Qué es la base de datos del NCBI?
NCBI alberga genoma secuenciado en GenBank, y un índice de los artículos biomédicos de investigación en PubMed Central y PubMed, así como otra información relevante a la biotecnología . Todas estas bases de datos son accesibles en línea con el motor de búsqueda de Entrez.
¿Qué es NCBI y su función?
NCBI alberga genoma secuenciado en GenBank, y un índice de los artículos biomédicos de investigación en PubMed Central y PubMed, así como otra información relevante a la biotecnología . …
¿Cómo se usa el NCBI?
Práctica: NCBI y Entrez
- Conectarse a Entrez, el interfaz gráfico del NCBI.
- Entrar en la base de datos Nucleotide y buscar con la expresión Bacillus subtilis bofC.
- Aparece una lista con las entradas que encajan con la búsqueda.
- Seleccionar la entrada que tiene menos genes (X93081).
¿Qué es fasta en NCBI?
FASTA: Formato muy básico que consta de un encabezado precedido por ‘>’ donde se da información, y tras un salto de carro la secuencia de ADN o aminoácidos. Un ejemplo de secuencia en formato FASTA: http://www.uniprot.org/uniprot/Q4JFS1.fasta.